Alper Köse, 1987 yılında İstanbul Teknik Üniversitesi Uçak Mühendisliği bölümünden mezun olmuştur. 1989 yılında T.C. Cumhurbaşkanlığı Savunma Sanayii Başkanlığında göreve başlamıştır. 2001 yılında ABD’deki San Diego kentinde bulunan National University’ de “International Business” konusunda MBA programını tamamlamıştır. 2006 yılına kadar Ar-Ge programları ve havacılık programlarında görev almıştır. 2006 yılında Kalite-Test ve Sertifikasyon Daire Başkanlığına bağlı Test ve Sertifikasyon Şube Müdürlüğü görevine atanmış ardından 2010 yılında Sertifikasyon Müdürü olarak görevine devam etmiştir. 2014 yılında Deniz Araçları Daire Başkanlığına bağlı Destek Gemisi Projeleri Grup Müdürlüğü görevine, yine aynı yılın sonunda da Uluslararası İş Birliği Daire Başkanlığında Ortadoğu Afrika Müdürlüğünde Savunma Sanayii Uzmanı olarak atanmıştır. 2016 yılında ise Deniz Araçları Daire Başkanı olarak görevlendirilmiştir.